Идея создания Иваном IV в Вологде северной опричной резиденции оказалась реализованной далеко не полностью. Сооружение кремля было лишь начато: возвели стену с девятью башнями с юго-восточной стороны и две башни с пряслом между ними на юго-западном углу. Внутри детинца близ берега реки построили каменный соборный храм, а невдалеке от него – деревянный царский дворец с домовой церковью Иоакима и Анны. Одновременно были произведены грандиозные инженерно-гидротехнические работы по усилению мощи кремля.