Первое каменное строение на архиерейском дворе, двухэтажное, с мезонином, появилось около 1659 года. Архиепископ Маркел вместо деревянных келий построил здесь каменное здание архиерейских палат. На стенах некоторых комнат была фресковая роспись, закрытая потом известковыми побелками. Открыта она художником-реставратором А. И. Брягиным в 1945 году. Перекрытия первого и второго этажей сводчатые, стены гладкие. Толщина стен около двух метров. Окна второго этажа размещены в глубоких нишах. Первый этаж здания без окон, предназначался он под погреба. Два входа в подвалы оформлены наличниками со стрельчатым верхом. 
Каменная лестница, ведущая в мезонин, расположена в толще стены. Здесь хранились архиерейская казна, ценности, царские и патриаршие грамоты. С постройкой Симоновского корпуса в мезонине разместился «казенный приказ», позднее это здание стало называться Экономским корпусом.