Дом, в котором у богатых голландских купцов Гоутман при своих посещениях города всегда останавливался Петр I [1] [Купцы Гоутман с 1652 г. вели значительную торговлю аптекарскими товарами «на Москве и у города Архангельского и на Вологде и в Ярославле и Великом Новгород?». В жалованной грамоте Петра от 1702 г. на имя Ивана Гоутмана, владельца двора е Вологде, перечислены дарованные ему царем различные привилегии, среди которых главной было право беспошлинной торговли.], расположен на Советском проспекте, за пристанью у самой реки на высоком берегу. Доска над входом в дом с изображением герба города Вологды, литерами Н. R. S. и датой 1704 г. свидетельствует о том, что Иван Гоутман был, кроме того, и официальным представителем Голландии [2] [Сокращенная надпись Н. R. S. в переводе обозначает «Голландские Республиканские Штаты».]. 
Петра, очевидно, привлекало расположение дома у реки в месте издавна, признанном удобным для отправки судов в Устюг и Архангельск. 
На противоположном берегу еще при Грозном существовала верфь, на которой строился флот для предполагаемого царем «путного шествия» с целью открытии морского пути в Китай и Индию. В петровские времена здесь, по приказу царя, строились многочисленные дощаники и барки для переброски войска против шведов в Архангельск. 
В 1872 г. в связи с 200-летием со дня рождения Петра I дом, переменивший уже ряд владельцев и служивший к этому времени складом льна, был приобретен на общие средства местного дворянства, земства и городского управления. В 1885 г. в доме был открыт мемориальный музей. 
В результате неумелой реставрации в конце XIX и начале XX вв. архитектурный облик дома был несколько испорчен (карнизы, наличники окон и т. д.). И все же большая бесстолпная сводчатая палата с железными связями и примыкающее к ней маленькое помещение в которых развернута экспозиция музея, сохранили характер жилого помещения XVII в. Цветные изразцы печей можно датировать тем же столетием, но центральные вставки с изображением короны относятся ко времени устройства в доме музея.