Николаевская Глинковская приходская церковь, как писалось в старинных документах, «находится в первой части города Вологды, близ южной черты его, на мысе, образуемом слиянием речек Содемки, Чернавки и Копани, составляющих в дальнейшем своем течении речку Золотуху, выкопанную по повелению царя Иоанна Грозного и впадающую в реку Вологду. Название «Глинковская» церковь получила от толстого надпочвенного слоя глины, образовавшегося здесь при упомянутом копании речки Золотухи. Но это название ее не древнее и стало употребляться только со второй половины XVIII столетия. А до того времени она писалась «Николаевскою, что в Разсыльщичьей Слободе», или «что в Разсылыциках». Но название «Николаевская» также не первоначальное и не самое древнее. Первоначально она называлась Флоро-и-Лаврскою, что подтверждено документами. Так, в окладных книгах церквей города Водогды, найденных в старом консисторском архиве, церковь эта в продолжении двадцати лет (с 1618 по 1639 год) постоянно писалась Флоро-и-Лаврскою, хотя в это время и существовал при ней престол во имя Св. Николая Чудотворца. С 1640 года и все последующее время она в архивных документах является уже с нынешним наименованием Николаевскою.
Церковь Николая Чудотворца на Глинках. Точное время постройки нетзвестно. Частично разрушена в 1930 году
Время и случай первоначального построения Глинковской церкви и древнейшая ее история неизвестны. По обстоятельствам, которые будут изложены ниже, можно с уверенностью утверждать, что Глинковская церковь существовала задолго до XVII столетия. Известно, что до 1676 года церковь была деревянная и состояла из двух отдельных храмов – Николаевского и Флоро-Лаврского. В Писцовой книге г. Вологды 1628 года сказано: «за речкою за Золотухою, да за речкою за Содемкою в Старой Разсылыцичье Слободе церковь Николы Чудотворца, другая церковь Флора и Лавра, обе деревяны клетцки...»
Нынешняя каменная двухэтажная церковь построена в 1676 году, на иждивение прихожан, согласно «храмозданной грамоте» Преосвященного Маркела архиепископа Вологодского и Белозерского.
«Божиею милостию смиренный Преосвященный Маркел, архиепископ Вологодский и Белозерский. Бил челом нам великому господину с Вологды с посаду Разсыльщичьей Слободы Никольской поп Артемей да церковный староста Архип Иконник, и вместо всех прихожан, а в челобитной их писано, чтоб нам их пожаловать благословить и велеть у них в Разсыльщичьей Слободе, по их обещанию, церковь каменную воздвигнуть во имя Всех Святых да другой престол во имя Николая Чудотворца, да св. мучеников Флора и Лавра, и под то церковное строение подошвы крепить, рвы копать и сваи бить и бут бутить, и о том бы им дать наша благословенная грамота. И аз великий господин Преосвященный Маркел, архиепископ Вологодский и Белозерский, Разсыльщичьей Слободы Никольского попа да церковного старосту Архипа Иконника и всех Никольских прихожан пожаловал, благословил и велел под церковное каменное строение подошву крепить, рвы копать и сваи бить и бут бутить и церковь во имя Всех Святых и в пределах службы во имя Николая Чудотворца и св. мучеников Флора и Лавра строить и о том велел им дать благословенную грамоту. А как у них та каменная церковь и пределы совершится, и им явится нам великому господину и на освящение того храму и пределов от соборной церкви взять святые антиминсы. К сей благословенной грамоте великий господин Преосвященный Маркел... велел печать свою приложить».
Внизу грамоты имеется следующая приписка: «184 (1676) году, марта в 12 день, от святыя великия соборныя и апостольская церкви Софеи Премудрости Слова Божия дан святый антиминс».
К памятному событию Глинковской церкви относится факт проживания во Флоро- Лаврском приходе Преподобного Галактиона, основателя Свято-Духова монастыря, вологодского Чудотворца. Этот факт важен и при определении древности церкви. Пр. Галактион родился в Москве в 1535 году. Из его жизнеописания известно, что в Вологду он пришел «уже будучи в зрелом возрасте», т.е. примерно в 1570 году или за сто с лишним лет до постройки каменной Глинковской церкви. Этот факт подтверждает наше заключение о том, что Глинковская церковь была основана (построена) задолго до XVII века.
Интерес представляет и то, что наружный вид церкви значительно изменен по сравнению с первоначальным, старинным.
В 1848 году Вологодские Губернские Ведомости опубликовали статью с описанием Глинковской церкви. В статье говорится, что церковь эта первоначально была пятиглавая. Окна в нижнем этаже были круглые, а в верхнем – длинные и узкие (щелевидные), крыши – дуговые.
В 1770 году в связи с обнаруженными повреждениями в своде и в стенах главного корпуса были снесены четыре главы и переделана крыша. В первые годы XIX века пробиты новые окна, в верхнем этаже вышиною в два, а в нижнем – в полтора квадрата. Удивительно, что когда таранами пробивали окна в нижнем этаже, из стены выпал огромный дикий камень, который тяжестью своею совершенно сдвинул с места престол и жертвенник во Флоровском приделе. Этот придел пришлось вновь освещать.
В 1930 годах церковь частично разрушили. В настоящее время она восстанавливается и уже действует.