Выдающийся церковный деятель второй половины XV – начала XVI века Спиридон-Савва последние годы своей жизни провел в Ферапонтовом монастыре, где около 1503 года и был похоронен. Биографические данные о нем отрывочны. Наиболее раннее известие записано под 1476 годом в Типографской летописи: «Того же лета прииде из Царяграда в Литовьскую землю митрополит, именем же Спиридон, а родом тверитин, поставлен по мзде патриархом, а повелением турскаго царя».
То, что митрополит был поставлен патриархом Константинопольским, повлекло за собой большие пререкания в разных слоях общества. В 1470-х годах шла ожесточенная борьба за митрополию «всея Руси» между Московским и Литовским митрополитами. Владыка Спиридон, выступив в качестве третьего претендента, получил от Константинопольского патриарха Рафаила посвящение в этот сан. Прибыв в 1476 году в Литву, он, однако, был посажен королем Казимиром в заточение; в 1483 году он приехал в Москву.
Когда и при каких обстоятельствах митрополиту Спиридону удалось освободиться из заточения и перебраться на Русь, остается неизвестным. В Москве к его притязаниям на Киевскую (всероссийскую) митрополию отнеслись тоже отрицательно. Надежда на помощь великого князя Иоанна III не оправдалась. Поставление в митрополиты «в области безбожных турков поганскаго царя» расценивалось тогда так же, как поставление в Риме «от латинян». Вскоре по прибытии на Русь, между 1483 и 1503 годами, он оказался в ссылке в Ферапонтовом монастыре.
Митрополит Спиридон был высокообразован, прекрасно владел пером. В Ферапонтовом монастыре он написал наиболее известный публицистический и богословский труд «Изложение о православной истинней нашей вере», посвященный описанию семи Вселенских Соборов и обличению на них ересей. Не скрывает автор и своего отношения к полемике с еретиками, подчеркивая при этом приверженность православию и предавая проклятию еретиков. В «Изложении» митрополит упоминает о своем поставлении и изгнании.
Здесь же, на Белоозере, около 1503 года им было завершено житие Зосимы и Савватия Соловецких. Составлением его занимался бывший соловецкий игумен Досифей, ученик преподобного Зосимы. Благословил его на этот труд архиепископ Новгородский Геннадий, который был учеником преподобного Савватия еще на Валааме. Досифей написал о том, чему сам был свидетелем, что запомнил из рассказов учителя и записей, сделанных под диктовку преподобного Германа Соловецкого. Но записки эти пропали, и Досифей восстанавливал их по памяти. Не считая себя писателем, он стыдился явиться со своим трудом к владыке Геннадию и, направляясь в Москву по делам монастыря, заехал в Ферапонтову обитель. Здесь он обратился к митрополиту Спиридону за помощью, прося удобрить «грубое писание».
В том виде, который житию придал владыка Спиридон, игумен Досифей и отвез его к архиепископу Геннадию. Тот похвалил соловецкого биографа за то, что он нашел такого искусного излагателя. Рукопись Досифея Спиридон, видимо, дополнил, расспросив соловецкого игумена – об этом говорит приписка в рассказе об одном из чудес: «Се поведа священно инок Досифей».
Архиепископ Геннадий видел в митрополите Спиридоне не только искусного писателя и большого знатока церковной литературы – он его ценил, «понеже бе муж мудр, измлада извыче и добре умея божественная писания новая и ветхая», и называл его «столп церковный».
Третий значительный труд, под названием «Послание о Мономаховом венце», тоже приписывается исследователями митрополиту Спиридону. Он создавал его, будучи уже 90-летним старцем. В книге собраны данные о происхождении династии русских великих князей. Начиная рассказ с потомков Ноя, Спиридон проводит генеалогическую связь предков великого князя Василия III с римским императором Августом через Пруса, будто бы родственника Рюрика. В «Послании» приводится известие о том, что Владимир Мономах получил царский венец от византийского императора, и тем самым доказывается древность и законность владения русских князей царскими достоинствами.
Василия III он называет, как и Владимира Мономаха, «вольным самодержцем и царем», то есть так, как в официальной практике того времени они еще не назывались. Свое изложение Спиридон дополнил родословием литовских князей, поставив их по происхождению значительно ниже русских. В центре повествования оказались и тверские князья, деятельность которых митрополит определяет как ведущую в общерусских событиях XIV века. Эту особенность произведения можно отнести к происхождению автора – «тверитин», в последующих редакциях эта часть была устранена.
«Послание» было написано в ответ на запрос какого-то очень влиятельного лица, имя которого не сохранилось. Автор записал об этом так: «Потребовал еси от нас своим писанием и нашими чернецы». Видимо, некто обратился сам письменно и через ферапонтовских монахов. «Послание» легло в основу «Сказания о князьях владимирских», которое широко использовалось в политической практике русского централизованного государства XVI века.
В «Послании о Мономаховом венце» автор называет себя двойным именем: «Спиридон, рекомый Сава глаголемый». Второе имя, вероятно, получено им при пострижении в схиму. По другим произведениям он известен как Спиридон. Летописи тоже называют его Спиридоном.
Среди скупых известий об обстоятельствах жизни опального митрополита в Ферапонтовом монастыре есть упоминание, что все необходимое он делал своими руками, чтобы никому не быть в тягость. Утешал же себя тем, что и апостолы претерпевали унижение.
Скончался митрополит Спиридон-Савва в 1503 году. Его имя записано в древнейшем синодике Ферапонтова монастыря ранее имени великой княгини Софьи, умершей в 1503 году. Похоронен владыка на монастырском кладбище Ферапонтова монастыря – в каком месте, неизвестно.