Эндомиксис (от эндо... и греч. míxis — смешение), периодическая перестройка ядерного аппарата у некоторых инфузорий. Открыт в 1914 у Paramecium aurelia американскими учеными Л. Вудреффом и Р. Эрдман, которые описали при Э. разрушение макронуклеуса и двукратное деление микронуклеуса; часть продуктов деления без слияния (оплодотворения) превращается в макронуклеусы, часть в микронуклеусы, остальные погибают. Позднее было показано, что в таком виде перестройки ядра у инфузорий не бывает — дифференцировке макро- и микронуклеусов предшествует слияние ядер (по типу самооплодотворения, или автогамии). Следовательно, Э. — одна из форм полового процесса.