Основными рыбохозяйственными водоемами Вологодской области являются крупные озера Белое, Кубенское и Воже. Особенности организации рыболовства на данных водоемах в постсоветский период могут быть обозначены двумя взаимосвязанными тенденциями. Во-первых, произошло изменение форм хозяйствования при замене государственного промышленного лова на предпринимательскую деятельность и разрешении лицензионного лова. Во-вторых, с каждым годом увеличивается число негосударственных организаций и предпринимателей, осуществляющих промышленный лов, а также граждан, ведущих любительский и лицензионный лов. Это сопровождается ростом числа орудий лова и значительным уменьшением контроля над их использованием. К настоящему времени давление промысла на рыбные запасы достигло беспрецедентного в истории рыболовства на водоемах области уровня, особенно на популяции ценных видов рыб. Так, только по официальным данным, на Белом озере за последние пять лет по сравнению с 1980-ми гг. в промышленном лове стали участвовать втрое больше рыбаков, а общее количество орудий лова увеличилось в среднем в четыре раза. При этом число плавных сетей выросло примерно в три раза, а выставляемых ставных сетей для промышленного лова – в два раза (более 5.5 тыс. шт. в год). Число орудий лицензионного лова (около 4.3 тыс. шт.) вполне сопоставимо с общим количеством орудий промышленного рыболовства. Аналогичная ситуация сложилась и на других водоемах области. Несмотря на значительное увеличение промысловой нагрузки, общие уловы рыбы, по данным официальной статистики, значительно сократились. Например, величина общих уловов рыбы на Белом озере за последние пять лет меньше показателей 1980 гг. примерно в два раза. Причиной этого является рост неучтенного вылова из-за процветающего браконьерства. Ориентировочно величина ежегодных промышленных и любительских уловов рыбы (без учета вылова снетка) на Белом озере в течение пяти последних лет составляет около 1900 т, что в шесть раз выше данных официальной статистики. Таким образом, ежегодно укрывается около 1600 т рыбы стоимостью около 100 млн. руб. Аналогичная ситуация сложилась и на озерах Кубенском и Воже. На Кубенском озере объем рыбы, ежегодно добываемой за счет промышленного лова и рыбаками-любителями (без учета лицензионного лова), по нашей экспертной оценке составляет около 955 т, что в четыре раза больше официальной статистики. Аналогичные показатели на оз. Воже составляют в среднем 240 т, что в три раза больше статистических данных. Учитывая огромное количество орудий лицензионного лова на озерах Кубенском (более 2.4 тыс. шт.) и Воже (около 1,3 тыс. шт.), а также высокую долю крупноячейных жаберных сетей, истинная величина лицензионных уловов на этих водоемах также намного выше официальных данных.
Чрезмерная промысловая нагрузка и селективное изъятие привели к резкому сокращению промысловых запасов ценных видов рыб. Нежелательными следствиями являются изменение структуры рыбного населения в сторону мелких видов рыб, сдвиг в сторону r-стратегии, что обусловливает изменение популяционных показателей. Наиболее опасная ситуация сложилась на Белом озере, на котором запасы судака – основного промыслового вида данного водоема – за последние пять лет снизились в пять раз и произошло резкое омоложение стада. Уменьшился промысловый запас леща Кубенского озера, у которого численность достигших промысловой меры особей за последние пять лет снизилась более чем в два раза. Для восстановления промысловых запасов рыбы в водоемах Вологодской области необходимо изменить стратегию рыболовства с адекватным контролем вылова. Это неизбежно связано с сокращением количества промысловых орудий, с ограничением предпринимательской деятельности и лицензионного лова, который, по сути, носит коммерческий характер. Недопустима экономическая заинтересованность усиления эксплуатации рыбных запасов через механизм лицензионного лова и «волевого» распределения квот на научно-промысловых и рыбохозяйственных советах.