Коллекция памятников мелкой пластики раннего периода в музее небольшая. Панагии, кресты, подвесные иконы из металла, кости, дерева и камня в основном были вкладами в северные монастыри и храмы. Многие из них выполнены столичными мастерами. Так, московской работой начала XV века считают большую круглую серебряную панагию со сценой Вознесения на верхней створке (илл. 29). По краям ее идет черневая надпись и тонкий вьющийся стебель с трилистниками. Предположительно, панагия является вкладом великого князя Василия II Темного в Спасо-Каменный монастырь по случаю посещения им обители в 1447 году.

29. Панагия с изображением Вознесения. 1447 г. 30. Мученик Евстафий Плакида. Каменная икона.  XIV в.

      Спасо-Каменный монастырь, располагавшийся на острове посреди Кубенского озера, был основан в 1260 году, когда белозерский князь Глеб Василькович, переправляясь через озеро, едва не погиб во время бури. 6 августа его струг прибило к Каменному острову, где князь обнаружил монастырь столь бедный, что в нем даже не было церкви. В благодарность за свое спасение он сделал в монастырь богатый вклад, заповедав построить церковь в честь Преображения Господня, а также кельи для иноков. О том, насколько важной была роль этого монастыря в духовной жизни Русского Севера, свидетельствует тот факт, что в 1418 году его игумен Дионисий, грек по происхождению и постриженник Афонской горы, был поставлен в епископы Ростовские. Постриженниками Спасо-Каменного монастыря были преподобные Александр Куштский и Дионисий Глушицкий.
      В числе ранних памятников мелкой пластики, представленных в экспозиции, необходимо отметить небольшую икону Евстафия Плакиды XIV века в серебряной оправе, выполненную из серо-зеленого камня (илл. 30). Она также происходит из Спасо-Каменного монастыря. По преданию, Евстафий во время охоты увидел оленя с крестом между рогами и услышал голос, повелевавший ему принять крещение. Святой изображен на коне с копьем в левой руке. Поднятая вверх правая рука всадника знаменует крайнее удивление. В сегменте неба слева вверху изображен крест, напоминающий о видении святого. Судя по характеру резьбы с мягко-округлыми линиями икона, вероятно, является работой московских мастеров. В то же время некоторые исследователи выдвигают версию о византийском происхождении этого памятника.
      Одним из наиболее интересных предметов в собрании музея является большой запрестольный крест, получивший название Киликиевского (илл. 31-33). По преданию, этот крест попал на Русь из области Киликия в Малой Азии, а в XIV веке был принесен в вологодские земли самим Димитрием Прилуцким и водружен на месте будущего Спасского собора Прилуцкого монастыря. Однако результаты исследования памятника специалистами дают основания датировать его первой половиной XVI века. Не исключено, что крест был вложен в Спасо-Прилуцкий монастырь Василием III или его сыном Иваном IV Грозным. Предположительно, в 1552 году Киликиевский крест находился в войсках Ивана Грозного при походе на Казань.

31. «Киликиевский» крест. Первая половина XVI в. Лицевая сторона 32. «Киликиевский» крест. Оборотная сторона 33. «Киликиевский» крест. Костяная пластина на лицевой стороне: Распятие

      Крест вырезан из дерева и обложен медной золоченой басмой. В специальных углублениях помещены 84 резные пластины из кости с изображениями праздников и святых. Эти вставки выполнены в разное время; некоторые из них не соответствуют размерам углублений. Вероятно, подлинные первоначальные пластинки со временем были утрачены, и их заменили новыми, предназначенными для других произведений.
      К первой половине XVI века относятся наиболее ранние костяные пластины: «Распятие с предстоящими», «Предста царица», «Спас Нерукотворный», «Святой благоверный князь Феодор с сыновьями Давидом и Константином», «Святые князья Борис и Глеб», «Преподобные Ефрем Перекомский и Савва Вишерский» и «Святые равноапостольные царь Константин и царица Елена». Судя по манере исполнения, они могли быть созданы одним мастером. Резьба тонкая, деликатная, фигурки святых легки и изящны.
      Интересным образцом резьбы по камню XV века является поклонный крест из белого известняка со сценой Распятия на одной стороне и сценой Сретения на другой (так называемый «Лахмакурский») (илл. 34). Высокое качество резьбы свидетельствует о том, что крест исполнен опытным и умелым мастером. По периметру ветвей креста идет рамка с резным орнаментом в виде полосы треугольников с трехгранными углублениями. Крест происходит из деревянной часовни при деревне Лахмакурье, неподалеку от села Устье. Эта местность находилась в центре Заозерского княжества, через нее пролегала дорога в Кирилло-Белозерский монастырь, по которой на богомолье к северным чудотворцам ездили московские великие князья.
      По представленным в музее образцам искусства Русского Севера можно судить о том, что самостоятельная художественная традиция сформировалась в этих местах уже в достаточно ранее время — по меньшей мере, к середине XV столетия.
      Второй большой раздел экспозиции посвящен, главным образом, искусству XVI века. Это столетие стало для Вологодского края временем значительного социального и торгово-ремесленного развития, политического возвышения и расцвета духовной жизни. С открытием Северного морского пути Вологда становится крупным перевалочным пунктом в торговле со странами Запада и Востока. По указанию Ивана Грозного в Вологде разворачиваются грандиозные работы по строительству крепости и Софийского собора. В 1571 году город стал центром Вологодско-Пермской епархии. Несомненно, перенос кафедры немало способствовал совершенствованию местного церковного искусства: иконописи, стенных росписей, лицевого шитья, мелкой пластики.